Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl39lQ9CQD0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms