Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NepnQ9CQ76 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms