Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpa3Q9CQ71 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms