Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
StambpQ9CQ26 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
StambpQ9CQ26 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms