Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc18Q9CQ07 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms