Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl17Q9CPR4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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