Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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