Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms