Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NsmfQ99NF2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms