Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atoh8Q99NA2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atoh8Q99NA2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms