Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrrtQ99MR6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms