Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms