Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms