Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rcbtb2Q99LJ7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms