Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5lQ99LH9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp5lQ99LH9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms