Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms