Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lysmd3Q99LE3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lysmd3Q99LE3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms