Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pagr1aQ99L02 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms