Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms