Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms