Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf19Q99KJ5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms