Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Emc3Q99KI3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms