Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hps4Q99KG7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms