Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Me2Q99KE1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms