Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GatbQ99JT1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms