Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms