Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Csmd1Q923L3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Csmd1Q923L3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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