Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms