Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a4bQ91ZP4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc5a4bQ91ZP4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc5a4bQ91ZP4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc5a4bQ91ZP4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc5a4bQ91ZP4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc5a4bQ91ZP4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc5a4bQ91ZP4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a4bQ91ZP4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms