Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd3Q91WC0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms