Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc3Q91W40 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms