Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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