Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Slc6a20aQ8VDB9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Slc6a20aQ8VDB9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Slc6a20aQ8VDB9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Slc6a20aQ8VDB9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Slc6a20aQ8VDB9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Slc6a20aQ8VDB9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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