Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms