Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApobrQ8VBT6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms