Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms