Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N3

Vmn1r189, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r189Q8K3N3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r189Q8K3N3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r189Q8K3N3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms