Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms