Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sde2Q8K1J5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms