Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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