Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33aQ8K0Y2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms