Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FgbQ8K0E8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms