Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfm1Q8K0D5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms