Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms