Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms