Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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