Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms