Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG73

Rpgrip1l, Protein fantom, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1lQ8CG73 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1lQ8CG73 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1lQ8CG73 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms