Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEZ1

Smco1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco1Q8CEZ1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco1Q8CEZ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms