Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms